Flüge nach Faro werden von einigen Linien- und Charterfluggesellschaften sowie auch Billigfliegern (z.B. Ryanair) täglich aus Deutschland angeboten.

• Air Berlin: Berlin, Köln, Dresden, Düsseldorf, Hamburg, Leipzig, München, Münster Osnabrück, Nürnberg, Paderborn
• Germania: Düsseldorf, Hannover, München
• Germanwings: Köln, Stuttgart
• HI Hamburg International: Hamburg, München
• Lufthansa: Frankfurt, München
• Ryanair: Frankfurt International, Frankfurt-Hahn, Düsseldorf Weeze
• Transavia: Düsseldorf Weeze
• TUIfly: Düsseldorf, Frankfurt, Hannover, Hamburg, München, Stuttgart
• Mit TAP Air Portugal kann man auch nach Lissabon fliegen, von dort einen Mietwagen nehmen und an die Algarve reisen (als Alternative); von Lissabon nach Lagos ca. 300 km, Fahrtzeit ca. 3 Stunden.

Buchen kann man direkt auf den Seiten der Anbieter, aber auch oft günstiger auf den bekannten Portalen.